📅13 maja 1981 roku, na Placu św. Piotra w Rzymie, Jan Paweł II został postrzelony przez tureckiego zamachowca Mehmeta Ali Agcę. Ciężko ranny papież został przewieziony do kliniki Gemelli, gdzie przeszedł operację trwającą ponad 6 godzin. Po powrocie do zdrowia Jan Paweł II spotkał się z zamachowcem i odbył z nim długą rozmowę, wybaczając mu winy. W czerwcu 2000 r. prezydent Włoch, Carlo Azeglio Ciampi, ułaskawił Ağcę. i na jego prośbę został ułaskawiony. Po zamachu wprowadzono specjalne środki bezpieczeństwa (m.in. papamobile został odpowiednio opancerzony).
Mehmet Ali Agca obecnie mieszka na przedmieściach Stambułu i utrzymuje się z honorariów za swoje książki. Angażuje się w obronę praw zwierząt i określa się jako "papież bezdomnych zwierząt w Stambule”.